日本战国时期，分属不同大名的忍者集团也在暗处进行着角力在一个月朗星稀的夜晚，伊贺忍者耶麻汰（三元雅芸 饰）、阵内（柏原收史 饰）、老鼠等人执行刺探任务时意外与对手相碰，期间天空中忽然飘过一个巨大的火球，令众人颇感意外。耶麻汰等回到村中后，在首领的指示下又去森林中探查火球的真相。途中他们邂逅同属一派的凛林（肘井美佳 饰）及其同伴，众人结伴同行。结果在密林中，伊贺忍者们遭到不明生物的袭击。对方敏捷迅速，杀伤力巨大，忍者们接二连三遇害。耶麻汰、阵内、凛林等人虽侥幸逃出，殊不知来自外星的异型正大肆繁衍。　　一时间，伊贺村落惨遭荼毒，耶麻汰等也面临前所未有的挑战……