21世纪初期，地球不再有侵略和战争，人类期盼已久的和平终于到来了地球防卫军组织也因此完成了历史使命，TPC(地球和平联合)组织成立，人类迎来了新的的时代。但是，在实现世界性非武装化的2007年，地球又突然出现了怪兽。如超古代文明人幽怜所预言：二大怪兽“哥尔赞”及“美尔巴”出现了。在怪兽攻击的目标--金字塔内，发现了3座巨大的石像。2座巨像被怪兽摧毁了！在这紧要关头，有着超古代人遗传子、属于地球和平联合特搜查队(TPC)。“GUTS”分队的大古队员、全身被光所包围，并融身于剩下的1座巨像内--迪迦·奥特曼在现代复活了！迪迦的故事随之展开。